Abstract
We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes.
Original language | English |
---|---|
Pages (from-to) | 941-952 |
Number of pages | 12 |
Journal | Science |
Volume | 314 |
Issue number | 5801 |
DOIs | |
State | Published - Nov 10 2006 |
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Dive into the research topics of 'The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus'. Together they form a unique fingerprint.Cite this
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In: Science, Vol. 314, No. 5801, 10.11.2006, p. 941-952.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus
AU - Sodergren, Erica
AU - Weinstock, George M.
AU - Davidson, Eric H.
AU - Cameron, R. Andrew
AU - Gibbs, Richard A.
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PY - 2006/11/10
Y1 - 2006/11/10
N2 - We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes.
AB - We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=33750995860&partnerID=8YFLogxK
U2 - 10.1126/science.1133609
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